1890年(光绪十六年)

    夏末  卫河先后于临清胡家湾、张家窑及馆陶马头等处决口。

    秋初  黄河水倒灌入运河，运河护堤多处被冲毁。

1891年(光绪十七年)    

    八月  临清境内遭受虫灾。

    本年  聊城书业德书店创立，是为境内木版印刷之始。

1892年(光绪十八年)

    十二月  寿张人杨木、郑显之等聚众起义，遭山东巡抚福润镇压，杨木被捕，郑显之遭追捕。

1893年(光绪十九年)

    六月  黄河于东阿小生庄、阳谷陶城铺等处决口；卫河在冠县境内决口，境内村庄半数被淹。

    本年  阳谷境内耕牛灾疫流行，病、死者极多。

     Δ四川松潘人洪用舟任东昌府知府。

1894年(光绪二十年)

    本年  聊城县建立公立钱局，承办征收田赋、税款、零星存储和整批上缴等业务。

1895年(光绪二十一年)

    秋  黄河漫决，卫运河涨溢，沿河村庄多被淹没。

    本年  疏浚阳谷陶城铺至临清运河段100多公里。

1896年(光绪二十二年)

    本年  聊城县知县凌芬在城内义学旧宅改建摄西书院。       

1897年(光绪二十三年)

    三月十六日   冠县梨园屯村民阎书勤等人反对外国传教士在本村改庙建堂，率梅花拳民攻打教堂，打死教民1人，驱逐教民20余家，并拆毁教堂，重新盖起玉皇庙。事后，东昌知府洪用舟即赴冠县查办，阎书勤等被迫逃至外地。

1898年(光绪二十四年)

    六月  黄河在东阿县王家坡民埝决口，聊城、茌平两县一片汪洋。    

    Δ  朱红灯率领义和拳拳民在茌平等地反对外国教会侵入。    

     八月  威县义和拳首领赵三多统率各路拳民在冠县蒋家庄马场祭旗起事提出“灭洋”口号，发动反帝爱国斗争。

     十一月三日  冠县红桃园拳民焚毁红桃园、小李固等处教堂及教民房舍60多间，杀死教民2人、伤1人。        

     十一月四日  驻直隶、山东清军镇压在两省交界处活动的义和拳，4名拳民不幸牺牲，拳民首领姚洛奇等15人被捕。

    本年  冠县梨园屯阎书勤组织义和拳，提出“扶清灭洋，杀尽天主教”的口号。他们转战临清、聊城、曹州、济南等地。   

     Δ     聊城考院撤销。    

     Δ    江南江都人刘坝任东昌府知府。1899年(光绪二十五年)

    春  朱红灯在茌平设拳场800余处，并提出“先学义和拳，后学红灯照，杀了洋鬼子，灭了天主教”的口号，先后焚毁梁庄、王相庄、八里庄等处教堂。

十月十八日  朱红灯率领茌平义和团援救平原县拳民，与清军战于平原县森罗殿，清军死3人、伤10多人。

    十一月十四日  朱红灯和高唐拳民首领心诚和尚率团围攻张庄天主教堂。次日，将教堂焚烧。之后，义和团被清军包围，朱红灯于二十一日在博平县五里庄被捕，二十三日心诚和尚在高唐杨庄被捕，十二月二十四日在济南同时被山东巡抚毓贤杀害。

    十一月二十八日    义和团首领王立言等率领高唐义和团百余人攻打禹城韩庄教堂，未克。继之，屯军伏击高唐州李联奎所率清军。后被知州李恩祥镇压。

    本年  安徽黄山人王乐修任东昌府知府。